医院的污水，除一般生活污水外，还含有化学物质、
放射性废水和
病原体。因此，必须经过处理后才能排放，特别是肝炎等传染病病房排出来的污水，须经消毒后才可排放。无集中式
污水处理设备的医院，对有传染性的粪便，必须单独消毒使其
无害化。常用消毒剂有
漂白粉、
液氯、
次氯酸钠、
臭氧。对含放射性
同位素的污水，应按同位素处理要求处理。
医院污水在处理过程中，沉淀的污泥含有大量的细菌、病毒和寄生虫卵，须经消毒（常用熟石灰消毒）或
高温堆肥后方可用作肥料。
医院各部门的功能、设施和人员组成情况不同，产生污水的主要部门和设施有：诊疗室、化验室、病房、洗衣房、
X光照像洗印、动物房、
同位素治疗诊断、
手术室等排水。医院行政管理和医务人员排放的
生活污水，食堂、单身宿舍、家属宿舍排水。不同部门科室产生的污水成分和水量各不相同，如
重金属废水、
含油废水、洗印废水、
放射性废水等。而且不同性质医院产生的污水也有很大不同。
医院污水较一般生活污水排放情况复杂。
医院污水来源及成分复杂，含有病原性微生物、有毒、有害的物理化学污染物和
放射性污染等，具有空间污染、急性传染和潜伏性传染等特征，不经有效处理会成为一条疫病扩散的重要途径和严重污染环境。