生物除臭塔一般2级配合使用，第一级加湿，第二级加生物填料进行处理有机恶臭废气，恶臭废气经过管道收集装置将恶臭气体送到废气系统的增湿洗涤装置，废气系统增湿循环装置采用高压雾化喷嘴，将水充分雾化后与气流混合，迅速使待处理的气体湿度达到饱和状态，为生物过滤工序的稳定运行创造了良好的条件。经增湿处理后的废气经气体分布器由下而上进入生物过滤器装置，利用附着在反应器内填料上的微生物，在新陈代谢过程中将废气中的污染物降解为简单的无机物和微生物细胞质，水溶液中的恶臭成分被微生物吸附、吸收，恶臭成分从水中转移至微生物体内，进入微生物细胞的恶臭成分作为营养物质为微生物所分解、利用，从而实现除臭达标排放。
生物除臭过滤净化系统的核心为高效复合生物滤塔或滤池、有利于生物附着和生长附着填料及高效复合微生物菌种，使复合生物滤塔或滤池中的微生物在适宜的环境条件下，在有机生物填料表面形成生物膜，生物膜中的微生物利用废气中的无机和有机物作为碳源和能源，通过降解恶臭物质维持其生命活动，并将恶臭物质分解为水、二氧化碳和矿物质等无臭物。
生物除臭技术除臭效率高、处理彻底、操作简便、无二次污染、运行费用低等优势。
由于废气需要和生物菌有足够的接触时间，因此设备会很大。风量大于1W风量时应选用生物除臭滤池设备进行处理，效果更理性。
生物除臭塔的工艺流程恶臭气体经过管道收集后进入预处理装置，经水洗加湿使废气的湿度增加，湿气体再进入生物除臭塔，使恶臭气体物质的转化持续进行，经净化后的气体由引风机引出排放。