气箱脉冲除尘器采用水冲式排灰，即落入灰斗的灰通过电动锁气器排入冲灰水箱后由地沟排走。在冬季会出现在锅炉刚启用后或长时间停运重新投运气箱脉冲除尘器时灰斗堵灰的问题。分析得知，这是由于灰斗结露和电动锁气器封闭不严引起的。冬季室外温度较低，除尘器启动后，热烟气进入灰斗会在冰冷的灰斗壁结露，而此处又属烟气滞流区，不能被烟气快速加热，使得落入灰斗的灰粘在灰斗壁造成堵灰；同时电动锁气器封闭不严会使冲灰水箱内的“水气”被吸入灰斗，在灰斗下灰口处凝结也容易造成堵灰。另外，灰斗加热装置功率小、安装位置不合理也是造成灰斗堵灰的原因。因此，在灰斗的设计中要在充分考虑当地的气温和排灰形式的基础上核算灰斗加热装置的功率和安装位置，在布袋启动控制中要加入灰斗预热程序；同时，要选用可靠、封闭性能较好的锁气器，并加强灰斗的保温。
目前，由于玻纤滤料的大量选用，其高运用温度可达280℃，对高于这一温度的气体必需采取降温措施，对低于露点温度的气体必需采取提温措施。对气箱式脉冲除尘器来说，运用温度与除尘速率关系并不明显，这一点不同于电除尘，对电除尘器来说，温度的变化会影响到粉尘的比电阻等影响除尘速率。
气箱式脉冲除尘器箱体的油漆掉落，发作漏雨的情况和螺栓及周边密封的不严密的情况。因而关于高温和高湿的气体来说，为了除尘器避免结露和除尘器的正常运转，应当给除尘器进行保温的措施。可以用岩棉、玻璃棉、聚苯酯等资料进行保温。除尘器的保温层被雨水淋湿，简单使箱体腐蚀，因而，放在露天的除尘器，下雨时相应要有充沛的保护措施。
脉冲布袋除尘器滤袋的预涂层应在燃烧或生产工艺开始之前，先切断并停止清灰系统，打开脉冲布袋除尘器的进风口阀门（包括各个滤袋室的进风口及出风口阀门）。启动风机逐步增加除尘器的气流量，直至达到设计风量的70%左右，并记录每个室的除尘器滤袋内外阻力。在除尘器总进风管道的开口处（通常是烟气测试口）投入干燥无油的预涂粉。灰粉目数要求小于200目，水分含量小于1%。按每平米过滤面积350-450g的灰粉投入进去。脉冲布袋除尘器开始投粉前，确定引风机风量在70%以上，务必是的旁路阀处于关闭状态，提升阀处于在线状态。风机负荷运转直至预涂灰结束约20分钟，以为均匀顺畅地分布在各个灰斗里面。在预涂灰的时候，各个室里面上升的压差反映，例如，起初压差假如在100Pa，预涂灰后少要增加到350～400Pa，也就是说增加250～300Pa，如没有，预示着预涂灰失败，需重新进行。在脉冲布袋除尘器预涂灰工作完成的情况下，停下风机安排人员进入除尘器净气室检查，如果有发现花板孔或花板与箱体电焊处有出现漏灰现象，要检查脉冲布袋除尘器滤袋袋头与花板之间的密封性是否严密，若不严密，需进行调整。做完脉冲布袋除尘器滤袋预涂灰后，若没有问题，系统运行到正常设计参数，随后开启除尘器的清灰系统，除尘器进入正常操作运行。
气箱布袋除尘器在运行当中，发现除尘器后面的排气筒出口有灰尘泻出，并且粉尘量很大，这时要检查滤袋与花板孔安装的是否严密，滤袋是否有破损，有的脉冲布袋除尘器进风道与出风道仅用隔板分开，须检查中间隔板是否焊接严密。在过滤速度的选取中，必需根据处理气体的入口含尘浓度确定，切不可为缩小设备，而盲目采用过高过滤速度，它将直接影响除尘器的净化效果。根据国内目前实际应用中的经验，脉冲布袋除尘器过滤速度一般宜职2.5~3米/分为宜。脉冲布袋除尘器综合了分室反吹和脉冲喷吹清灰各类袋收尘器的优点，克服了分室反吹清灰强度不够，脉冲喷吹清灰和过滤同时进行的缺点，因而扩大了脉冲布袋除尘器的应用范围，由于这种类型的收尘器的结构有其特点，所以提高了收尘速率，延长了滤袋的使用寿命。
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